З’явилася нова суперзброя, і кораблі Гаміли зникли з морів. Тим часом Ямато покинув Велику Магелланову Хмару та повертається до галактики Чумацький Шлях. Під час плавання екіпаж зазнає удару гатлантського флоту воїнів під командуванням Горана Дагама, який вважає «Ямате» своєю здобиччю. Після того, як командир Сусуму Кодай відмовляється віддати корабель, Ямато втікає та аварійно Іллі потрапляє в дивний світ, який суперечить логіці та законам фізики. Команда експедиції відправляється на поверхню і робить справді карколомний досвід, від якого вони не можуть уникнути. Крім того, команда, здається, не самотня після зустрічі зі своїми старими ворогами. Час спливає, і Ґаміли й Террони ходять по тонкій межі у світі, який їм не належить, а гатлантійці сидять у них на шиї.