Минуло кілька місяців відтоді, як Томоя зізнався у коханні Наґісі, і його життя продовжує рухатися вперед, оскільки він продовжує зустрічати різноманітних нових людей, розширюючи свій світ у процесі. У той час як світ Томої продовжує розширюватися, його та Наґіса стосунки вступають у нову фазу, і жоден із них не зовсім впевнений, куди це їх приведе. Через його стосунки з Нагісою, Томоя починає розуміти сенс і важливість сім'ї. Але коли Томоя та Нагіса створюють власну сім’ю, вони стикаються з багатьма труднощами на своєму шляху в Clannad: After Story (Джерело: Sentai Filmworks, відредаговано) Примітка. Включає 2 ненумеровані «додаткові» та «підсумкові» епізоди, які вийшли в ефір наприкінці серіалу.
