Шай трохи подорослішав після боротьби з «Амаларейками», очолюваними таємничим хлопчиком Стигмою. Коли вона повертається до Японії, вона зустрічає дівчину на ім’я Ай Теннудзі, яка втекла зі свого села ніндзя. Ай розкажи s Сором’язлива, що покинула село, щоб переслідувати члена «Амаларейка». Тим часом відбувається інцидент, під час якого Токіо раптово огортається чорною кулею і зникає. Герої відправляються рятувати Токіо.