У 1999 році гігантський космічний корабель прибульців розбився на острові Південна Атарія. Людство намагається відновити це диво, але політичні конфлікти навколо Макросу призводять до глобальної війни. Через 10 років Війни за Об’єднання нарешті закінчилися, новий Уряд Землі Організації Об’єднаних Націй є i n живлення, і робота над Macross завершена. У день церемонії запуску його головна гармата стріляє самостійно, знищуючи космічний корабель прибульців. Цей доленосний день знаменує початок війни між людьми на Макросі та Зентраді, расою гуманоїдних прибульців гігантських розмірів.